Dakar, Sénégal · UN-CHK

Nous intégrons les savoirs des communautés à la science moléculaire pour documenter
ce que l’Afrique sait.

Le Sall Lab travaille avec des communautés de praticiens traditionnels, du terrain au laboratoire, pour documenter et comprendre la biodiversité médicinale africaine à l’aide des sciences omiques et de l’analyse des données.

Biologie moléculaire
Sciences omiques
Bioinformatique
Savoirs traditionnels

Recherche

Axes de recherche

Authentification génomique et biodiversité médicinale. Les plantes médicinales d’Afrique de l’Ouest constituent un patrimoine thérapeutique très peu documenté à l’échelle moléculaire. Nous développons des approches omiques (génomique, transcriptomique, métabolomique) pour authentifier, caractériser et cartographier la diversité génétique des espèces médicinales du Sénégal. L’objectif est de construire une infrastructure de données de référence qui n’existe pas encore pour la flore ouest-africaine.

Savoirs traditionnels et souveraineté des données. Les connaissances que les communautés de praticiens détiennent sur leurs plantes précèdent et complètent la caractérisation moléculaire. Nous travaillons à leur intégration dans les pipelines omiques : documentation avec les communautés concernées, confrontation aux données génomiques, développement de cadres de gouvernance qui en assurent la protection.

Infrastructure bioinformatique et formation. La production de données omiques en Afrique ne peut pas dépendre durablement de capacités analytiques situées ailleurs. Nous construisons un pipeline intégré (terrain, laboratoire humide, calcul haute performance) au sein duquel les étudiants du programme de Licence et Master en Génétique Moléculaire et Bioinformatique à l’Université Numérique Cheikh Hamidou Kane (UN-CHK) sont formés par la pratique, contribuant directement à la production scientifique du laboratoire.

Infrastructure

  • Calcul haute performance Kàkkatar v1 Infrastructure en cours de déploiement à Dakar · Objectif opérationnel 2026
  • Réseau de terrain Accès aux communautés de praticiens et aux sites de collecte au Sénégal et en Afrique de l’Ouest
  • Laboratoire humide Paillasses installées · Équipement en cours

Équipe

Investigatrice
Principale.

Dr. Khadidiatou Sall · PI

Dr. Khadidiatou Sall

Investigatrice Principale · Biologiste Moléculaire et Bioinformaticienne

Thèmes de recherche

Sciences omiques
Bioinformatique
Biodiversité africaine
Biologie des semences
Savoirs traditionnels
Souveraineté des données
Gouvernance des savoirs

MEMBRES DU LABORATOIRE

Ousseynou Ben Diouf

Bioinformaticien

Alassane Salam Diop

Technicien de laboratoire

Opportunités ouvertes selon projets et collaborations : étudiants en master, doctorants, postdoc et chercheurs associés. Contacter directement Dr. Sall.

Collaborateurs

Prof. Ousmane Sall

UN-CHK · Informatique sémantique (web sémantique, intelligence artificielle)

Prof. El Hadji Mamadou Nguer

UN-CHK · Informatique

Dr. Mama Racky Ndiaye

USSEIN · Génétique des populations

Dr. Absa Gassama

UN-CHK · Sociologie · Réseaux de praticiens traditionnels

Formation

GMBIO —former par la recherche et l’action.

Les étudiants participent directement aux activités du Sall Lab et sont formés à la médiation scientifique par SeeSD, deux dimensions complémentaires d'une formation ancrée dans le terrain.

Programme

Génétique Moléculaire & Bioinformatique (GMBIO)

La Licence GMBIO à l’UN-CHK s’inscrit dans une initiative du MESRI lancée en 2016 pour positionner le Sénégal dans les sciences émergentes. Après une première phase interrompue en 2019, le programme a été repris par l’UN-CHK. Depuis 2021, Dr. Sall, responsable de la formation, dirige le développement du programme : structuration pédagogique, recrutement des enseignants, encadrement des étudiants et intégration progressive des activités de recherche.

172

Étudiants inscrits

65%

Femmes

5

Cohortes

2 776

Candidatures 2024

Engagement communautaire

Science Citoyenne · SeeSD

Les étudiants du programme sont formés à la médiation scientifique et déployés par SeeSD pour des actions de promotion de la culture STEAM (sciences, technologies, ingénierie, arts et mathématiques) auprès des communautés, en langues locales. La science et les savoirs communautaires se nourrissent mutuellement.

6 000+

Personnes impactées depuis 2015

70+

Médiateurs actifs

3

Régions couvertes

7M+

Vues en 2025

Collaboration

Collaborer avec
le Sall Lab.

Le Sall Lab mobilise une capacité de terrain, de laboratoire et d’analyse ancrée localement. Nous documentons les savoirs avec les communautés, collectons le matériel végétal, produisons les données et les analysons sur place. Nous cherchons des partenaires scientifiques partageant cette vision, en Afrique et à l’international.

Nous sommes ouverts à

Collaborations de recherche
Co-encadrement de doctorants
Mobilité de chercheurs
Consortiums de recherche internationaux
Co-soumissions internationales
01
Accès au terrain et aux communautés
Biodiversité médicinale, sites de collecte, savoirs documentés au Sénégal et en Afrique de l’Ouest.
02
Capacité intégrée
De la collecte communautaire au séquençage — une chaîne complète terrain → laboratoire → analyse.
03
Infrastructure analytique
Calcul haute performance en cours de déploiement à Dakar, objectif opérationnel 2026.
04
Formation et mobilité
Étudiants en master et chercheurs disponibles pour co-encadrements et projets collaboratifs.

Publications

Travaux
sélectionnés.

2025
Strengthening Genomic Sovereignty in Africa: The African Bioinformatics Center for Omics (ABCOMICS) Project
Gueye K., Mane K., Mboup P.A., Diop M.F., Shehu M., Ahadzie B., Diame M.L., Dieng I., Diop O., Faye A., Kotanmi B., Mboup M.N., Mboowa G., Nuredin M., Ndour P.A., Ndiaye A., Cisse B., Diamanka A., Diop G., Gueye M., Sall K., Sarr I., Thiare O. and Mboup S.
Journal of Biosciences and Bioengineering, 13(1)
2019
DELAY OF GERMINATION 1-LIKE 4 acts as an inducer of seed reserve accumulation
Sall K., Dekkers B.J.W., Nonogaki M., Katsuragawa Y., Koyari R., Hendrix D. and Nonogaki H.
The Plant Journal, 100(1), 7–19
2017
Transcriptomics of nine-cis-epoxycarotenoid dioxygenase 6 induction in imbibed seeds reveals feedback mechanisms and long noncoding RNAs
Sall K., Nonogaki M., Katsuragawa Y., Hendrix D. and Nonogaki H.
Seed Science Research, 27(4), 251–261
2014
Amplification of ABA biosynthesis and signaling through a positive feedback mechanism in seeds
Nonogaki M., Sall K., Nambara E. and Nonogaki H.
The Plant Journal, 78(3), 527–539
Salllab-2_3x
Navigation
Contact
Dr. Khadidiatou Sall · Sall Lab · UN-CHK · Dakar, Sénégal